RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538758.1

RIMKLB-208, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member B, human

TSL 3

Gene RIMKLB, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758		Q56UQ5	140 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PLET1	Q6UQ28	207 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ATP6V0B	Q99437	205 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	TXN2	Q99757	166 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	LGALS9	O00182	355 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CORT	O00230	105 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CCS	O14618	274 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	MED6	O75586	246 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM50A	O95807	157 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IFNA10	P01566	189 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IAPP	P10997	89 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NPY1R	P25929	384 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	OR4C12	Q96R67	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NOTCH1	P46531	2555 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF320	A2RRD8	509 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	WRB	O00258	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	EDN2	P20800	178 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	OPRK1	P41145	380 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NPBWR1	P48145	328 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PAX9	P55771	341 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	OR4X1	Q8NH49	305 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PEMT	Q9UBM1	199 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SORL1	Q92673	2214 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	C5orf51	A6NDU8	294 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	C2orf70	A6NJV1	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM25E	A8MYX2	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NDUFA4	O00483	81 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	GNG7	O60262	68 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRAF2	O60831	178 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CLN5	O75503	358 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IGLV1-51	P01701	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	FOLR2	P14207	255 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CBLN1	P23435	193 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CD69	Q07108	199 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IL15RA	Q13261	267 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	SMIM8	Q96KF7	97 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	C2orf50	Q96LR7	162 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RIMKLB-208	ENST00000538758	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM213	A2RRL7	107 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	IFNA4	P05014	189 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	C8orf88	P0DMB2	117 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC25A4	P12235	298 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	RAB11A	P62491	216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	PALMD	Q9NP74	551 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758		A8MWP6	167 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRSS46	E5RG02	174 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758		K7EIL1	84 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758		K7EMT4	169 aa		6.95	□□□□□ -1.3
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3

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