RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527333.5

CKAP5-208, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene CKAP5, Length 498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-208ENST00000527333 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 NANPQ8TBE9 248 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RPEQ96AT9 228 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 P2RX4Q99571 388 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MGST2Q99735 147 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.18□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 A0A1W2PRD5 423 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 A0A1W2PRF3 423 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 A0A1W2PRM7 423 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 OPN1MWP04001 364 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FGF7P21781 194 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PAX6P26367 422 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MAS1LP35410 378 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MFAP2P55001 183 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RAB2AP61019 212 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 AKR1C1Q04828 323 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 CD69Q07108 199 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MMD2Q8IY49 270 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF114Q8NC26 417 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM231Q9H6L2 316 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 KIAA1456Q9P272 454 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 A0A1W2PN81 502 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 BTBD17A6NE02 478 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 AGPAT2O15120 278 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SCO1O75880 301 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 LY6G6DO95868 133 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 CHRNA7P36544 502 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RAB11AP62491 216 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GUK1Q16774 197 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 LFNGQ8NES3 379 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 C8orf49Q96NF6 230 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SEC11CQ9BY50 192 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FBXL15Q9H469 300 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 TNCP24821 2201 aa7.16□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 A0A0U1RQK1 487 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PSMB11A5LHX3 300 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SOX15O60248 233 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 MPDU1O75352 247 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PRH1P02810 166 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 FBP1P09467 338 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 HNF1AP20823 631 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 OPRK1P41145 380 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF616Q08AN1 781 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GAMTQ14353 236 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 ICAM4Q14773 271 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SSX2Q16385 188 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GUCA2BQ16661 112 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 KLK9Q2XQG4 91 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 LCE1DQ5T752 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 THAP8Q8NA92 274 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PIFOQ8TCI5 191 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 RARRES2Q99969 163 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.15□□□□□ -1.26
CKAP5-208ENST00000527333 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.14□□□□□ -1.27
CKAP5-208ENST00000527333 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.14□□□□□ -1.27
CKAP5-208ENST00000527333 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CKAP5-208ENST00000527333 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CKAP5-208ENST00000527333 MOSP00540 346 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms