RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522878.5

ARFGEF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARFGEF1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-208ENST00000522878 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 ARL9Q6T311 187 aa3.57□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.57□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF138P52744 262 aa3.56□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 TAS2R41P59536 307 aa3.56□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 BIN3Q9NQY0 253 aa3.55□□□□□ -1.84
ARFGEF1-208ENST00000522878 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.55□□□□□ -1.84
ARFGEF1-208ENST00000522878 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ARFGEF1-208ENST00000522878 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.54□□□□□ -1.84
ARFGEF1-208ENST00000522878 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.54□□□□□ -1.84
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ARFGEF1-208ENST00000522878 IFI30P13284 250 aa3.54□□□□□ -1.84
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