RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CRYGDP07320 174 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MYF5P13349 255 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TCL1AP56279 114 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MIC13Q5XKP0 118 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 Q6P435 159 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PARM1Q6UWI2 310 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 hDV102S1A0JD36 115 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CER1O95813 267 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRR20EP86478 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRR20CP86479 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRR20DP86480 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRR20BP86481 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRR20AP86496 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 DDB2Q92466 427 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 COQ2Q96H96 371 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 APOA2P02652 100 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CA3P07451 260 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 IGFBP2P18065 325 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ARL4DP49703 201 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ERASQ7Z444 233 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 NUP35Q8NFH5 326 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 FOXB1Q99853 325 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 A0A087X0K7 114 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TNFRSF6BO95407 300 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MOSP00540 346 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SPINK8P0C7L1 97 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 HBBP68871 147 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 DUSP13Q9UII6 198 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PPC4 97 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 H3BUT2 72 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 J3QT63 122 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SYNGR1O43759 233 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 CT45A10P0DMU9 189 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 NTF4P34130 210 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF146Q15072 292 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 STPG3Q8N7X2 389 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 TEX45Q8NA69 505 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 SPINK4O60575 86 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 COL9A1P20849 921 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 FXYD3Q14802 87 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 KIR3DS1Q14943 382 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 Q6AWC8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 Q6ZUT4 128 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PIFOQ8TCI5 191 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 RHODO00212 210 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 KIR2DS2P43631 304 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 OR1L3Q8NH93 324 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 MDFICQ9P1T7 246 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-208ENST00000514387 A1L4Q6 167 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 DEFA4P12838 97 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC29Q8WV35 223 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 DEPPQ9NTK1 212 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 FGF6P10767 208 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF492Q9P255 531 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 HIGD1BQ9P298 99 aa7.21□□□□□ -1.26
GPBP1-208ENST00000514387 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms