RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 A0A0G2JRQ6 117 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 CORTO00230 105 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 NPPCP23582 126 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 TMEM187Q14656 261 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 TMEM231Q9H6L2 316 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 ENY2Q9NPA8 101 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 EXTL2Q9UBQ6 330 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PS18 150 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 CLN5O75503 358 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 IFNA4P05014 189 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 TBPP20226 339 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 OPRK1P41145 380 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 OR13C8Q8NGS7 320 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 TERB2Q8NHR7 220 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 ZFAND1Q8TCF1 268 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 ABHD1Q96SE0 405 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 UCP1P25874 307 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 Q6ZRM9 215 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 STHQ8IWL8 128 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 OR4X1Q8NH49 305 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 AP3S1Q92572 193 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 TMEM230Q96A57 120 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 METTL26Q96S19 204 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-211ENST00000513325 K7EQG2 157 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RAB3DO95716 219 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CD74P04233 296 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CRYBB3P26998 211 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RPL5P46777 297 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 P2RY1P47900 373 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CTF1Q16619 201 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 BSXQ3C1V8 233 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TIGITQ495A1 244 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM229BQ8NBD8 167 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 MARCH1Q8TCQ1 289 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1-17P01599 117 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R19P59542 299 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 SPCS3P61009 180 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 C2CD4CQ8TF44 421 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 KNCNA6PVL3 124 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 SCGB2A1O75556 95 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 B3GALNT1O75752 331 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GABARAPO95166 117 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CDS2O95674 445 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 OR5AC1P0C628 307 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 ZNF688P0C7X2 276 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 Q8NAQ8 132 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 DCANP1Q8TF63 244 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 C15orf40Q8WUR7 153 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GRAMD2BQ96HH9 432 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TMEM222Q9H0R3 208 aa12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 KMT2AQ03164 3969 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 HTR2BP41595 481 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRR20EP86478 221 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRR20CP86479 221 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRR20DP86480 221 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRR20BP86481 221 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRR20AP86496 221 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 AARDQ4LEZ3 155 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 FAAP20Q6NZ36 180 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 FAM219AQ8IW50 185 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 OR52E5Q8NH55 327 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GABARAPH6UMI1 98 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 GPR107Q5VW38 600 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 U3KQE9 123 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 FRAS1Q86XX4 4008 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 IGLL5B9A064 214 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 IGLC1P0CG04 106 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 SMIM18P0DKX4 95 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 SPP1P10451 314 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-211ENST00000513325 C4BPBP20851 252 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms