RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TEPP	Q6URK8	271 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508		E7EUB6	86 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	BCL2	P10415	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	NPBWR1	P48145	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	BPIFB3	P59826	476 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TIMM23	O14925	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	OR13C7	P0DN81	318 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CNTFR	P26992	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	HILS1	P60008	231 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CD69	Q07108	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	YIF1A	O95070	293 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CFHR4	Q92496	578 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	ACTL6B	O94805	426 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	LGALS4	P56470	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TNXA	Q16473	311 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	P2RX4	Q99571	388 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	FBP1	P09467	338 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	B2M	P61769	119 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	GAMT	Q14353	236 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508		Q6YL49	198 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A1W2PPV4	95 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	MOS	P00540	346 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR20E	P86478	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR20C	P86479	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR20D	P86480	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR20B	P86481	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR20A	P86496	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	SSX2	Q16385	188 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	NPB	Q8NG41	125 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TMEM18-208	ENST00000497508	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	PSMB3	P49720	205 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	MDFI	Q99750	246 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TMEM18-208	ENST00000497508	NBR2	O15453	112 aa		11.57	□□□□□ -0.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms