RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TXN2	Q99757	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		I3L2K1	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SCGN	O76038	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	MT-CO2	P00403	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FGF2	P09038	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SPP1	P10451	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NPPC	P23582	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	G6PC	P35575	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	F2R	P25116	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	GNRHR	P30968	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		A0A1W2PS18	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		K7EQG2	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM50A	O95807	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	AMBP	P02760	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RLN1	P04808	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	C4BPB	P20851	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NPBWR1	P48145	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	EMP1	P54849	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	HERV-K104	P61576	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		Q6ZR54	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		Q9H521	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RYR1	P21817	5038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702		A0A1B0GU03	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RFX2	P48378	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	PPP5C	P53041	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	RAP2B	P61225	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	CADM3	Q8N126	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CEP41-215	ENST00000495702	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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