RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 CAMLGP49069 296 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RAB14P61106 215 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRR20EP86478 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRR20CP86479 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRR20DP86480 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRR20BP86481 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRR20AP86496 221 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 MLANAQ16655 118 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFA5Q16718 116 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ACSM6Q6P461 480 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 Q8N2B8 174 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 OR2T6Q8NHC8 308 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 LYPD6BQ8NI32 183 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 SMR3AQ99954 134 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 MED9Q9NWA0 146 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 THYN1Q9P016 225 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00862A6NCI5 91 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 G3V318 75 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 AGPAT2O15120 278 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 CD99P14209 185 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RND2P52198 227 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RAB31Q13636 194 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZS46 218 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF709Q8N972 641 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 OR4X1Q8NH49 305 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF702PQ9H963 129 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ACANP16112 2415 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 CLN5O75503 358 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 IGLV1-40P01703 118 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 MBP02144 154 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRH1P02810 166 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 BLOC1S1P78537 153 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZRG5 221 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 STPG3Q8N7X2 389 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 OR5T1Q8NG75 326 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 NPIPB3Q92617 1050 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ACY3Q96HD9 319 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ATP6V0BQ99437 205 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TRGV9Q99603 122 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ZFHX3Q15911 3703 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 FAM223BA6NKX1 122 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 F8W735 103 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 YIF1AO95070 293 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFB8O95169 186 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TSPAN15O95858 294 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00869P0C866 280 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 IGLC1P0CG04 106 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 SRD5A1P18405 259 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 M6PRP20645 277 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 OR10J1P30954 320 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 FHITP49789 147 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 SELENOTP62341 195 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 MIC13Q5XKP0 118 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 NECAP1Q8NC96 275 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 CXorf58Q96LI9 332 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TXN2Q99757 166 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 VSIRQ9H7M9 311 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 ESM1Q9NQ30 184 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 RPRMQ9NS64 109 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM89A2RUT3 159 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 PSMB11A5LHX3 300 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 OR2J3O76001 311 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 HILS1P60008 231 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RAB2AP61019 212 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 B2MP61769 119 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF726P1Q15940 193 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-220ENST00000489318 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms