RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		11.19	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	GNG7	O60262	68 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	PITX3	O75364	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	NPY1R	P25929	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	DEFA1	P59665	94 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	DEFA3	P59666	94 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	MITD1	Q8WV92	249 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403		U3KQ87	197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ADAP1	O75689	374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.17	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	NDUFA4	O00483	81 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	IFNA4	P05014	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	CTSG	P08311	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	FOLR2	P14207	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SPN	P16150	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403		A8MWP6	167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	YIF1A	O95070	293 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	IAPP	P10997	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SLC25A4	P12235	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	GP9	P14770	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	CBLN1	P23435	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ADM	P35318	185 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	IFITM3	Q01628	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	WRB	O00258	174 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	SYNGR2	O43760	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM50A	O95807	157 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	RAB11A	P62491	216 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	MLANA	Q16655	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	CLN5	O75503	358 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	IL5	P05113	134 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		11.13	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403		K7EMT4	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	SCGB1D2	O95969	90 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	RND2	P52198	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	ID3	Q02535	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NOP58-208	ENST00000488403	EDN2	P20800	178 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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