RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 HIVEP2P31629 2446 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 M0R381 172 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 NUDT3O95989 172 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 CBLN1P23435 193 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 OR1P1Q8NH06 330 aa11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.08□□□□□ -0.63
HDLBP-241ENST00000487169 CEACAM4O75871 244 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF56Q15929 161 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 BRCA2P51587 3418 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PEX7O00628 323 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LILRA1O75019 489 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 SLC17A3O00476 420 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 AREGP15514 252 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 EFNA4P52798 201 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 RNF144BQ7Z419 303 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 NUP37Q8NFH4 326 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 SRP19P09132 144 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 C18orf12Q96KH6 178 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1W2PRX2 142 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS2P07478 247 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 RHOGP84095 191 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 CD69Q07108 199 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM178BH3BS89 294 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 MUC21Q5SSG8 566 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 KIR2DL4Q99706 377 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 M0QZK8 103 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 NAPSAO96009 420 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DRB1P01911 266 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TNFRSF14Q92956 283 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ALPK3Q96L96 1907 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 DPRXA6NFQ7 191 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LDLRAD4O15165 306 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LY6HO94772 140 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 OR9G9P0C7N8 305 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 BIVMQ86UB2 503 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 METRNQ9UJH8 293 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf44Q8N8P7 122 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 A6NDN8 102 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 UBE2L6O14933 153 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 HBBP68871 147 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PRCDQ00LT1 54 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 FAM166AQ6J272 317 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 RNF125Q96EQ8 232 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ADCYAP1P18509 176 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LEMD1Q68G75 181 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM42Q69YG0 159 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM136Q6ZRR5 245 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TUBA4BQ9H853 241 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 MPZP25189 248 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PKIAP61925 76 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 HERPUD1Q15011 391 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 CD177Q8N6Q3 437 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 A0A1B0GUT8 65 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 GGCTO75223 188 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 LRTM2Q8N967 370 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 KCNS1Q96KK3 526 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 Q9H3A6 140 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 U3KQA8 63 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PMCHL1Q16048 86 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 PLAURQ03405 335 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 ADIPOQQ15848 244 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 K7ENP7 123 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 GCSHP23434 173 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-241ENST00000487169 DYSFO75923 2080 aa11.03□□□□□ -0.64
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