RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TEX38Q6PEX7 206 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS20P59510 1910 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 GAMTQ14353 236 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF738Q8NE65 137 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM218A2RU14 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G2AP14555 144 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 C15orf32Q32M92 178 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 BSXQ3C1V8 233 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 BAGE2Q86Y30 109 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 STPG2Q8N412 459 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00862A6NCI5 91 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 USMG5Q96IX5 58 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 AGMATQ9BSE5 352 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 A0A0G2JRQ6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CLDN34H7C241 214 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TGOLN2O43493 480 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZRM9 215 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA1O95477 2261 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 FGF16O43320 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM17P0DL12 118 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPQ1 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRX2 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 GCHFRP30047 84 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 RNF125Q96EQ8 232 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 NAGKQ9UJ70 344 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GWJ7 208 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 MEOX2P50222 304 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PAX8Q06710 450 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CDSNQ15517 529 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 GPR82Q96P67 336 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SEC11CQ9BY50 192 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 FAM223BA6NKX1 122 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 B4DEV8 164 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 P01737 135 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 POU2AF1Q16633 256 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 AREGP15514 252 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CTRB1P17538 263 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 TREML4Q6UXN2 200 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PPI3 338 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 FHITP49789 147 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PTPRBP23467 1997 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ORM1P02763 201 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PAX6P26367 422 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 PRNTQ86SH4 94 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 HIVEP2P31629 2446 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V0E1O15342 81 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CD99P14209 185 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 CNTFRP26992 372 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-211ENST00000486161 DSCAMO60469 2012 aa6.66□□□□□ -1.34
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