RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 GNG4P50150 75 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 TCL1AP56279 114 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 PRR27Q6MZM9 219 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 CD177Q8N6Q3 437 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 COL12A1Q99715 3063 aa11.36□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 K7ERU9 68 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 BSPH1Q075Z2 132 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 EDDM3AQ14507 147 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 FXYD3Q14802 87 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 CENPWQ5EE01 88 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 DEFB125Q8N687 156 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 COQ2Q96H96 371 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 HELTA6NFD8 242 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 C2orf70A6NJV1 201 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 TOX4O94842 621 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-43DP0DP04 118 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 AREGP15514 252 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.35□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 HSBP1O75506 76 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 UBE2G1P62253 170 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 CATR1Q13166 79 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 LTC4SQ16873 150 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 RFESDQ8TAC1 157 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SMIM12Q96EX1 92 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 GAGE12BA1L429 117 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 FOXH1O75593 365 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 MT-CO2P00403 227 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SSTR5P35346 364 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SLAQ13239 276 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 RND1Q92730 232 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 M0R2Z0 102 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 ISLRO14498 428 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 NUDT3O95989 172 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 EFNB3Q15768 340 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.34□□□□□ -0.59
GPC1-208ENST00000469694 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 C12orf77C9JDV5 145 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-7P01780 117 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 CCL8P80075 99 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 LY6DQ14210 128 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 TMEM108Q6UXF1 575 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 DEFB108BQ8NET1 73 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 COL8A2P25067 703 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 UCNP55089 124 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 JKAMPQ9P055 326 aa11.33□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 ABCA4P78363 2273 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 J3QR06 171 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 IGHV1-46P01743 117 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 CRYBB3P26998 211 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 PRDX2P32119 198 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 RBPJQ06330 500 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 CDSNQ15517 529 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 OR13A1Q8NGR1 328 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 ST20Q9HBF5 79 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 PRSS46E5RG02 174 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 TIGITQ495A1 244 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 C1orf159Q96HA4 380 aa11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 SRRM5B3KS81 715 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 NPY1RP25929 384 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 CA7P43166 264 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 MUC21Q5SSG8 566 aa11.31□□□□□ -0.6
GPC1-208ENST00000469694 KIR3DL3Q8N743 410 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms