RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MSGN1A6NI15 193 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 A8MWP6 167 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 GPR183P32249 361 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 NRN1Q9NPD7 142 aa6.38□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HAX1O00165 279 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR2H2O95918 312 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 COPS9Q8WXC6 57 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.38□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.38□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 SLC25A17O43808 307 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 EMP1P54849 157 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ERVK11-1P61568 191 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 TCF23Q7RTU1 214 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CREBBPQ92793 2442 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.37□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 M0R3E3 92 aa6.37□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 GNG7O60262 68 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 PAXXQ9BUH6 204 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RNF126Q9BV68 326 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGF2RP11717 2491 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 FAM157AC9JC47 383 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ICAM4Q14773 271 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LINC01559Q495D7 138 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF488Q96MN9 340 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 DPM3Q9P2X0 92 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SERF1AO75920 110 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP54-210ENST00000466048 POLEQ07864 2286 aa6.36□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 J3QLI3 93 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGHV1-46P01743 117 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TYMSP04818 313 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SCGB1A1P11684 91 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 LMO1P25800 156 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 CKS1BP61024 79 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-7P01780 117 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 WNT2P09544 360 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 HSD52Q0P140 79 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 C18orf12Q96KH6 178 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.35□□□□□ -1.39
USP54-210ENST00000466048 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.35□□□□□ -1.39
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