RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444609.1

HDAC8-215, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC8, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM50AO95807 157 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 HLA-DQB1P01920 261 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 EVI2AP22794 236 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 NPBWR1P48145 328 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PAX9P55771 341 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TAS2R31P59538 309 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CD300CQ08708 224 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 FAM78BQ5VT40 261 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TPRA1Q86W33 373 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LRTM2Q8N967 370 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PAXXQ9BUH6 204 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 HINT2Q9BX68 163 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 VCX3BQ9H321 246 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 KCNK15Q9H427 330 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM140Q9NV12 185 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 MFNGO00587 321 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 FCGR3AP08637 254 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 SMIM19Q96E16 107 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LINC01600Q96MT4 127 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LINC00052Q96N35 136 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PECRQ9BY49 303 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 S100A14Q9HCY8 104 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CACNG5Q9UF02 275 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 F6UB75 175 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 ADAP1O75689 374 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 NQO2P16083 231 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 ELK1P19419 428 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 AMTNQ6UX39 209 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 A8MTW9 85 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 BPNT1O95861 308 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 HPRT1P00492 218 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM230Q96A57 120 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 C16orf74Q96GX8 76 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM56Q96MV1 263 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CENPOQ9BU64 300 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 VCXQ9H320 206 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 POMPQ9Y244 141 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 A0A0J9YX75 114 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 SNTNA6NMZ2 147 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 INSP01308 110 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CRYGDP07320 174 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LIMS3P0CW19 117 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 LIMS4P0CW20 117 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 WFDC2Q14508 124 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 NRG4Q8WWG1 115 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 DERL3Q96Q80 235 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 CIB1Q99828 191 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GAGE12BA1L429 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 A6NHS1 94 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GAGE7O76087 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GAGE12FP0CL80 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GAGE12GP0CL81 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GAGE12IP0CL82 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 TAS2R60P59551 318 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 LINC01587Q99440 93 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC8-215ENST00000444609 AQP12BA6NM10 295 aa6.63□□□□□ -1.35
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