RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A6AQ9H2W1 248 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GU03 582 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 GABARAPH6UMI1 98 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 CLN5O75503 358 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB2A1O75556 95 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 GPR107Q5VW38 600 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 STEAP1BQ6NZ63 245 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 GBGT1Q8N5D6 347 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 OR4X1Q8NH49 305 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JRQ6 117 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CDS2O95674 445 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3DO95716 219 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ETV6P41212 452 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SP6Q3SY56 376 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LILRB2Q8N423 598 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR52E5Q8NH55 327 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RARRES2Q99969 163 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 ENY2Q9NPA8 101 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PS18 150 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CRYBB3P26998 211 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OPRK1P41145 380 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SPCS3P61009 180 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MEF2DQ14814 521 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH1Q8TCQ1 289 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 FRAS1Q86XX4 4008 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 NPPCP23582 126 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 METTL26Q96S19 204 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MFFQ9GZY8 342 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 HTR2BP41595 481 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB131AP59861 70 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZRM9 215 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR11H2Q8NH07 326 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-17P01599 117 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AC1P0C628 307 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 DHODHQ02127 395 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 FAM24BQ8N5W8 94 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 NAA60Q9H7X0 242 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CTDSPLO15194 276 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM187Q14656 261 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf83Q53S99 150 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LEMD1Q68G75 181 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMS1-208ENST00000428064 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 DISC1C4P0D8 188 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 K7EQG2 157 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RGS5O15539 181 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MLANAQ16655 118 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS9CQ6DKI2 356 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 FAAP20Q6NZ36 180 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 STHQ8IWL8 128 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM230Q96A57 120 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RABAC1Q9UI14 185 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 IGLC1P0CG04 106 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 AKAIN1P0CW23 69 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A4P12235 298 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 P2RY1P47900 373 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH3B2P48448 385 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 DCANP1Q8TF63 244 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 GPR132Q9UNW8 380 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 U3KQE9 123 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 CTDSP2O14595 271 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 SPP1P10451 314 aa15.31■□□□□ 0.04
LIMS1-208ENST00000428064 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
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