RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 HSPB11Q9Y547 144 aa4.9□□□□□ -1.62
USP40-202ENST00000409945 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
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USP40-202ENST00000409945 BET1O15155 118 aa4.89□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 SLC22A5O76082 557 aa4.89□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 SLC31A2O15432 143 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 RDH8Q9NYR8 311 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 STHQ8IWL8 128 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 IFNA7P01567 189 aa4.87□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 HLA-DRB1P01911 266 aa4.87□□□□□ -1.63
USP40-202ENST00000409945 IFNA6P05013 189 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP40-202ENST00000409945 OR3A3P47888 321 aa4.87□□□□□ -1.63
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