RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD12-202ENST00000406506 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXD12-202ENST00000406506 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXD12-202ENST00000406506 ADMP35318 185 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ID3Q02535 119 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 NOXA1Q86UR1 476 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 PEMTQ9UBM1 199 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 LGALS9O00182 355 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 CTSGP08311 255 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 KRTAP10-11P60412 298 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 DEFA6Q01524 100 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 OR4C12Q96R67 309 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 C15orf62A8K5M9 175 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 A8MWP6 167 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 FAM25EA8MYX2 175 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 WRBO00258 174 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 GNG7O60262 68 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 NPBWR1P48145 328 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SCGB1D2O95969 90 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 CSN3P07498 182 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 MLANAQ16655 118 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 OR4X1Q8NH49 305 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF320A2RRD8 509 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 C5orf51A6NDU8 294 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 NDUFA4O00483 81 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SSSCA1O60232 199 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 LY86O95711 162 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM213A2RRL7 107 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 C2orf70A6NJV1 201 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 H3BP45 60 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SSNA1O43805 119 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 CLN5O75503 358 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 IGLV1-51P01701 117 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 IFNA4P05014 189 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SLC25A4P12235 298 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 EDN2P20800 178 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 CD69Q07108 199 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 C2orf50Q96LR7 162 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM50AO95807 157 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RND2P52198 227 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RAB11AP62491 216 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 MED28Q9H204 178 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD12-202ENST00000406506 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 RAB40CQ96S21 281 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 UFC1Q9Y3C8 167 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 PRSS46E5RG02 174 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 GOSR2O14653 212 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 FOLR2P14207 255 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 PAX9P55771 341 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 TM4SF20Q53R12 229 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 SMIM8Q96KF7 97 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 PSENENQ9NZ42 101 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 K7EPK0 472 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 SCGB2A1O75556 95 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 IGKV1-17P01599 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 IGLC1P0CG04 106 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 IL15RAQ13261 267 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXD12-202ENST00000406506 ACY3Q96HD9 319 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms