RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 WDR82Q6UXN9 313 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 TEX45Q8NA69 505 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FREM3P0C091 2139 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 H3BUT2 72 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CD55P08174 381 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 FOXC2Q99958 501 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 C12orf77C9JDV5 145 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 PEX7O00628 323 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 APOMO95445 188 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 CD69Q07108 199 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 LY6EQ16553 131 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 PNKDQ8N490 385 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 STPG1Q5TH74 334 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 DERL1Q9BUN8 251 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 MYLKQ15746 1914 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 LEPP41159 167 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ATXN8Q156A1 80 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ST20Q9HBF5 79 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 ARPC1AQ92747 370 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 VSIRQ9H7M9 311 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 PLCE1Q9P212 2302 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 HIGD1CA8MV81 97 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-202ENST00000400053 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 TGFAP01135 160 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 ID3Q02535 119 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-202ENST00000400053 OCC1Q8TAD7 63 aa7.43□□□□□ -1.22
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