RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398743.6

PRAME-202, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-202ENST00000398743 GGTLC3B5MD39 225 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 COX7A2P2O60397 106 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 GNG4P50150 75 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 BPIFB3P59826 476 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PRSS8Q16651 343 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 IGLC7A0M8Q6 106 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SELENOTP62341 195 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TNXAQ16473 311 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CENPWQ5EE01 88 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 THAP8Q8NA92 274 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 LINC00587B1AMM8 73 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 IGHV3-48P01763 117 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PDLIM4P50479 330 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RPL15P61313 204 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ZNF90Q03938 601 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 MORN5Q5VZ52 161 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 OR8B2Q96RD0 313 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 IL36BQ9NZH7 164 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.13□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RELNP78509 3460 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CRYGBP07316 175 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 COX7A1P24310 79 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CNTFRP26992 372 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 HCP5Q6MZN7 132 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.12□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ERVFC1-1P60608 527 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CDSNQ15517 529 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RPEQ96AT9 228 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 MISP3Q96FF7 219 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SLC17A3O00476 420 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 C22orf15Q8WYQ4 148 aa11.11□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 LIPFP07098 398 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 NHLH1Q02575 133 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 OR5I1Q13606 314 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TIGITQ495A1 244 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PATE2Q6UY27 113 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CORTO00230 105 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 AMBPP02760 352 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CRYGCP07315 174 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 SSX2Q16385 188 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 DNLZQ5SXM8 178 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PAXXQ9BUH6 204 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.1□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 MOSP00540 346 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 APELAP0DMC3 54 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 PYYP10082 97 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 MFAP2P55001 183 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 RPEL1Q2QD12 228 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TIMD4Q96H15 378 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 V9GYV3 84 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 C22orf46C9J442 243 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 LY6HO94772 140 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.09□□□□□ -0.63
PRAME-202ENST00000398743 POLEQ07864 2286 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 TRGV9Q99603 122 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 RNF5Q99942 180 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 FBXL15Q9H469 300 aa11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 TEX22C9J3V5 150 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 LY6LH3BQJ8 138 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 GCGP01275 180 aa11.07□□□□□ -0.64
PRAME-202ENST00000398743 ORM2P19652 201 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms