RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 GAFA1Q96PS6 74 aa16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 PRNDQ9UKY0 176 aa16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RPEL1Q2QD12 228 aa16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 FAM57AQ8TBR7 257 aa16.25■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 C22orf46C9J442 243 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 GNG4P50150 75 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 GNB4Q9HAV0 340 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 PKDREJQ9NTG1 2253 aa16.24■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 HELTA6NFD8 242 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 CD40P25942 277 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RPRMLQ8N4K4 120 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 IGHV3-48P01763 117 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 LGALS4P56470 323 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 CACNA1HO95180 2353 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 MT-CO2P00403 227 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.23■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 DSCAML1Q8TD84 2053 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 TANC2Q9HCD6 1990 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RTL8BQ17RB0 113 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 ZNF596Q8TC21 504 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RCHY1Q96PM5 261 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SPATA45Q537H7 98 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RND1Q92730 232 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 LINC00479Q96M42 142 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 PLEKHA3Q9HB20 300 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 V9GYV3 84 aa16.22■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 PLXNB1O43157 2135 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 hADV38S2A0JD32 116 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 NHLH1Q02575 133 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SSX8Q7RTT4 187 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 FAM19A2Q8N3H0 131 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 ATMQ13315 3056 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 HYPMO75409 117 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 MMP23AO75900 390 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 AMTP48728 403 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 NABP2Q9BQ15 211 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.21■□□□□ 0.19
PAN3-201ENST00000380958 DSCAMO60469 2012 aa16.21■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 KALRNO60229 2985 aa16.21■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 IGKV1-16P04430 117 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 TNFRSF1AP19438 455 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 ATOH7Q8N100 152 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 CLEC5AQ9NY25 188 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 OR51B2Q9Y5P1 312 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 NDUFS8O00217 210 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 NTF3P20783 257 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PAFAH1B2P68402 229 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRCDQ00LT1 54 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR27Q6MZM9 219 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 OR2D3Q8NGH3 330 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 NEUROG1Q92886 237 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 SLC45A2Q9UMX9 530 aa16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 SAP30O75446 220 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 COMPP49747 757 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 OR9G1Q8NH87 305 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 CCL13Q99616 98 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 TRAV5A0A0B4J249 113 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 J3QR06 171 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 FAM27E3Q08E93 113 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 OR10W1Q8NGF6 305 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 SMIM12Q96EX1 92 aa16.19■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 UPK2O00526 184 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 ZNF253O75346 499 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 LINC00869P0C866 280 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 WNT10AQ9GZT5 417 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 TACC2O95359 2948 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 SRIP30626 198 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR20EP86478 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR20CP86479 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR20DP86480 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR20BP86481 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 PRR20AP86496 221 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 BET1LQ9NYM9 111 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 POLEQ07864 2286 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 GGTLC3B5MD39 225 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 DIRC3C9JPN6 131 aa16.18■□□□□ 0.18
PAN3-201ENST00000380958 FAM216BQ8N7L0 139 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms