RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 UPK2O00526 184 aa11.92□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 CXCL1P09341 107 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R17O96001 155 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDLIM4P50479 330 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 CSRP2Q16527 193 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 HGFACQ04756 655 aa11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 APOMO95445 188 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 TYMSP04818 313 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLMPQ8WWB7 406 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARPC1AQ92747 370 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUDT11Q96G61 164 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 C15orf61A6NNL5 157 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 FOXH1O75593 365 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCN5AQ14524 2016 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 CRYGSP22914 178 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 EMP1P54849 157 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 FOXF2Q12947 444 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 YPEL1O60688 119 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSPOP30536 169 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 EFNB3Q15768 340 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 GLRX5Q86SX6 157 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 YPEL2Q96QA6 119 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRK1Q38SD2 2015 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.9□□□□□ -0.5
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANK1P16157 1881 aa11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 HEPN1Q6WQI6 88 aa11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 COLCA2A8K830 154 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00271P0C7V0 271 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDUFA3O95167 84 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF883P0CG24 379 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 ORMDL3Q8N138 153 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 MRAP2Q96G30 205 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 CD69Q07108 199 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 TTC28Q96AY4 2481 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 CD5P06127 495 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 ASIPP42127 132 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 KLRB1Q12918 225 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 FMC1Q96HJ9 113 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCL19Q99731 98 aa11.89□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A1B0GWB2 263 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 MOB4Q9Y3A3 225 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSPNO60542 156 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 NABP1Q96AH0 204 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 MPZP25189 248 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 NIT1Q86X76 327 aa11.88□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 TEX38Q6PEX7 206 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPDR1Q9UM22 224 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 JKAMPQ9P055 326 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 DERL1Q9BUN8 251 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 H3BUT2 72 aa11.87□□□□□ -0.51
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00205P59089 165 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms