RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLRD1Q13241 179 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR8B8Q15620 311 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZRM9 215 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAPTQ8N292 157 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC29Q8WV35 223 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A10P0DMU9 189 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 TFF3Q07654 80 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR1L1Q8NH94 360 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0J9YW62 118 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC30A6NM36 301 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 K7EMI3 77 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 SP9P0CG40 484 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF32P17041 273 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEX45Q8NA69 505 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR4A16Q8NH70 328 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIR2DL4Q99706 377 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PQM1 296 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PRE2 83 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 A1L4Q6 167 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 WIPF1O43516 503 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 CXorf1O96002 111 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 FGF6P10767 208 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXI1Q12951 378 aa8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
APOBEC3C-201ENST00000361441 hADV38S2A0JD32 116 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCTP09683 121 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 GCSHP23434 173 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 G6PCP35575 357 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 GAGE13Q4V321 117 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 GTSF1Q8WW33 167 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRELID3AQ96N28 172 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CACNG5Q9UF02 275 aa8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 PI4KAP42356 2102 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD300LBA8K4G0 201 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CD24P25063 80 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIR2DS4P43632 304 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM42Q69YG0 159 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 OSR2Q8N2R0 312 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPTSSAQ969W0 71 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF125Q96EQ8 232 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF488Q96MN9 340 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A096LPE4 126 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PPZ6 126 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV3-1P01715 115 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 GLRXP35754 106 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSG5Q15238 335 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8TCH9 128 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 C10orf35Q96D05 121 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1RLQ9NZP8 487 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.89□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXH1O75593 365 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAMPP49913 170 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR51H1Q8NH63 302 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR9G9P0C7N8 305 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A6P0DMU7 189 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A5P0DMU8 189 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A7P0DMV0 189 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 GATA4P43694 442 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 FXYD2P54710 66 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TAS2R45P59539 299 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 NRGNQ92686 78 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.88□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.87□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.87□□□□□ -0.99
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLK10O43240 276 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms