RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 GNG5P63218 68 aa17.12■□□□□ 0.33
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NISCH-201ENST00000345716 PSMB2P49721 201 aa17.11■□□□□ 0.33
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NISCH-201ENST00000345716 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa17.11■□□□□ 0.33
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NISCH-201ENST00000345716 STAG3L3P0CL85 134 aa17.06■□□□□ 0.32
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NISCH-201ENST00000345716 TRAV5A0A0B4J249 113 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 ADIPOQQ15848 244 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
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NISCH-201ENST00000345716 RHOGP84095 191 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 TMEM170AQ8WVE7 144 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 MGST2Q99735 147 aa17.04■□□□□ 0.32
NISCH-201ENST00000345716 TMEM70Q9BUB7 260 aa17.04■□□□□ 0.32
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