RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF343Q6P1L6 599 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf3Q8WVX3 66 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 S4R3C0 116 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 MFAP4P55083 255 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ACSM6Q6P461 480 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFA11Q86Y39 141 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF502Q8TBZ5 544 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V0BQ99437 205 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 GNB4Q9HAV0 340 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-201ENST00000345425 NUDT19A8MXV4 375 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 MLANAQ16655 118 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM217Q8N7C4 229 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 SLC35E1Q96K37 410 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 TXN2Q99757 166 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV3-48P01763 117 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV3-23P01764 117 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 S100A11P31949 105 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 OR5B12Q96R08 314 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 NEURL2Q9BR09 285 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 GGACTQ9BVM4 153 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 NPBWR1P48145 328 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 DLK1P80370 383 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 SLC38A11Q08AI6 406 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC140Q96MF4 163 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 TNFSF18Q9UNG2 199 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PRX2 142 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 RUNX1Q01196 453 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 NHLH2Q02577 135 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ARL16Q0P5N6 197 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 Q56UQ5 140 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 UBAC2Q8NBM4 344 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM116Q8NCL8 245 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 OR4X1Q8NH49 305 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 AQP10Q96PS8 301 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 HSPB11Q9Y547 144 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 COL6A5A8TX70 2615 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 I3L521 148 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 LILRB2Q8N423 598 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 FNDC10F2Z333 226 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 C1QBP02746 253 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 GAMTQ14353 236 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 SHISA2Q6UWI4 295 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC19AQ6UXS0 136 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 C18orf65Q6ZTR6 163 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 OR1S2Q8NGQ3 325 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 MDFIQ99750 246 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 HMSDA8MTL9 139 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 GNG7O60262 68 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 RND2P52198 227 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ATP6V1FQ16864 119 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ACY3Q96HD9 319 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ARPC5O15511 151 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 PFDN1O60925 122 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 SCGB2A1O75556 95 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC3BP05452 202 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 GPR183P32249 361 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 CD300CQ08708 224 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 OR11H4Q8NGC9 324 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 OR5C1Q8NGR4 320 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 TENM1Q9UKZ4 2725 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD34BA5PLL1 514 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 CLN5O75503 358 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 NPIPB3Q92617 1050 aa21.46■■□□□ 1.03
GIPC1-201ENST00000345425 SMCO3A2RU48 225 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 OR2T8A6NH00 312 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 F8W735 103 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 AKR1C1Q04828 323 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 C8orf86Q6ZUL3 223 aa21.45■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 RNF222A6NCQ9 220 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 SPSB3Q6PJ21 355 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 MFFQ9GZY8 342 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 NPVFQ9HCQ7 196 aa21.44■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 ARL3P36405 182 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 HYLS1Q96M11 299 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM147Q9BVK8 224 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 UQCC1Q9NVA1 299 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 TGOLN2O43493 480 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 ZFP69Q49AA0 526 aa21.43■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 TRBV12-3P01733 135 aa21.42■■□□□ 1.02
GIPC1-201ENST00000345425 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms