RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PPIAL4DF5H284 164 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 C16orf97H3BN30 126 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 COX7A2P2O60397 106 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 AMY1AP04745 511 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 MGST1P10620 155 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 GNB4Q9HAV0 340 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.65■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 HLA-DQA1P01909 254 aa22.64■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 BRS3P32247 399 aa22.64■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 BPIFB3P59826 476 aa22.64■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 C20orf144Q9BQM9 153 aa22.64■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 CBLN4Q9NTU7 201 aa22.64■■□□□ 1.22
UBP1-201ENST00000283628 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TMEM178BH3BS89 294 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 M0R143 59 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 WT1-ASQ06250 92 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 MORN5Q5VZ52 161 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 C10orf113Q5VZT2 155 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SAP30LQ9HAJ7 183 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 WASHC3Q9Y3C0 194 aa22.64■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ICE1Q9Y2F5 2266 aa22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 E7EUB6 86 aa22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 REG1BP48304 166 aa22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 THAP8Q8NA92 274 aa22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SNHG12Q9BXW3 62 aa22.63■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TRAV5A0A0B4J249 113 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 F2Z2F3 143 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 FCN3O75636 299 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 WFDC8Q8IUA0 241 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 DPRXA6NFQ7 191 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 CGB1A6NKQ9 187 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 NDUFB3O43676 98 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 LRRC10Q5BKY1 277 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 PAXXQ9BUH6 204 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 IZUMO1RA6ND01 250 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 IGLV2-23P01705 113 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ZNF137PP52743 207 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TBR1Q16650 682 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TMEM183BQ1AE95 376 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 FAM231DQ6ZW35 169 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SSX8Q7RTT4 187 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 GPX1P07203 203 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 RAB4AP20338 218 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TDGF1P3P51864 188 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 RASL11AQ6T310 242 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SERTAD4Q9NUC0 356 aa22.61■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 A0A0G2JNJ9 132 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SPINK4O60575 86 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 CD33P20138 364 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 TCL1AP56279 114 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 NPIPB3Q92617 1050 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 Q9UFV3 132 aa22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 K7ENP7 123 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 BSPH1Q075Z2 132 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 VMA21Q3ZAQ7 101 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 Q8NA96 180 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ZNF586Q9NXT0 402 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 MC5RP33032 325 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ZNF329Q86UD4 541 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 KCNS1Q96KK3 526 aa22.59■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 CDKN1AP38936 164 aa22.58■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 PATE2Q6UY27 113 aa22.58■■□□□ 1.21
UBP1-201ENST00000283628 PEX7O00628 323 aa22.58■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 PRRG2O14669 202 aa22.58■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC35B1P78383 322 aa22.58■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 PYYP10082 97 aa22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 NHLH1Q02575 133 aa22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 C10orf55Q5SWW7 151 aa22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 MIEN1Q9BRT3 115 aa22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 VAMP8Q9BV40 100 aa22.57■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 VSTM5A8MXK1 200 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 M0QZK8 103 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 BMPR1BO00238 502 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 FSTL3O95633 263 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 ETFRF1Q6IPR1 90 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 STXBP6Q8NFX7 210 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 VN1R17PQ8TDU5 208 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 CCL17Q92583 94 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 FXYD5Q96DB9 178 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 CHRDL1Q9BU40 450 aa22.56■■□□□ 1.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms