RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 SLC35E1Q96K37 410 aa14.77□□□□□ -0.04
PRDM12-201ENST00000253008 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PRDM12-201ENST00000253008 C8orf88P0DMB2 117 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PRSS33Q8NF86 280 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CTSZQ9UBR2 303 aa14.77□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PATE2Q6UY27 113 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 BAGE3Q86Y29 109 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 BAGE2Q86Y30 109 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SAP30LQ9HAJ7 183 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 GNB4Q9HAV0 340 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 NKX6-3A6NJ46 265 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 APOA2P02652 100 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 NUP37Q8NFH4 326 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SGK494Q96LW2 274 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 C16orf97H3BN30 126 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM178BH3BS89 294 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IGLV2-23P01705 113 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TNFRSF1AP19438 455 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TIGITQ495A1 244 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 RCHY1Q96PM5 261 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CHODLQ9H9P2 273 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.75□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PPIAL4DF5H284 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 DLL1O00548 723 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SLC25A17O43808 307 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CX3CL1P78423 397 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM177Q53S58 311 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 C1orf194Q5T5A4 169 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 HCP5Q6MZN7 132 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.74□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TAS2R45P59539 299 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 MOSP00540 346 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PPOXP50336 477 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CASP6P55212 293 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 GNG5P63218 68 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.73□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CNTFRP26992 372 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TPPP2P59282 170 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 A0A1W2PPI3 338 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 A0A1W2PRE2 83 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.72□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 COX7A2P2O60397 106 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 OSTCQ9NRP0 149 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 H3BTX0 84 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 FSTL3O95633 263 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM12-201ENST00000253008 C22orf46C9J442 243 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms