RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR1P1Q8NH06 330 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ASB13Q8WXK3 278 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MISP3Q96FF7 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM8Q96KF7 97 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RAB40CQ96S21 281 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KLK15Q9H2R5 256 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 U3KQ87 197 aa6.64□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CCNKO75909 580 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFB8O95169 186 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 BRI3O95415 125 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MPC2O95563 127 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 LY86O95711 162 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ELANEP08246 267 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR8U8P0C7N1 319 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CAV2P51636 162 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PAX9P55771 341 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R30P59541 319 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP10-3P60369 221 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RHOGP84095 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FGL1Q08830 312 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf83Q53S99 150 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NECAP1Q8NC96 275 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 THAP6Q8TBB0 222 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR4C12Q96R67 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 THYN1Q9P016 225 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.63□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JLM5 398 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PRX2 142 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FAM223BA6NKX1 122 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf62A8K5M9 175 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 E5RGE8 158 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 H0YIZ8 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 SMLR1H3BR10 107 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CORTO00230 105 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TSC22D2O75157 780 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-11P01762 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-23P01764 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IFNA4P05014 189 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OPRK1P41145 380 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RAB11AP62491 216 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5G2Q06055 141 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C15orf32Q32M92 178 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP14Q86UN6 197 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NOXA1Q86UR1 476 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RNF152Q8N8N0 203 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 DCUN1D4Q92564 292 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MBD2Q9UBB5 411 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 S4R3C0 116 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ATRQ13535 2644 aa6.62□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 NUDT19A8MXV4 375 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 I3L2K1 104 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MT-CO2P00403 227 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-48P01763 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 P2RY1P47900 373 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 KLK9Q2XQG4 91 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 Q5BKY6 102 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf56Q8N813 242 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 USMG5Q96IX5 58 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.61□□□□□ -1.35
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