RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SP6	Q3SY56	376 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BTNL8	Q6UX41	500 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TCF23	Q7RTU1	214 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM17	Q86X19	198 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SPSB4	Q96A44	273 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IL36G	Q9NZH8	169 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HSF4	Q9ULV5	492 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	KMT2D	O14686	5537 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CD300LB	A8K4G0	201 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		K7EPK0	472 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GPR31	O00270	319 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TOR1A	O14656	332 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PDCD6	O75340	191 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	OR5AC1	P0C628	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BCL3	P20749	454 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	FCGR2C	P31995	323 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	NPBWR1	P48145	328 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RBP2	P50120	134 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	FUT6	P51993	359 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	FXYD4	P59646	89 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	S100A10	P60903	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DEFA5	Q01523	94 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RSU1	Q15404	277 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PIGC	Q92535	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	TOMM40L	Q969M1	308 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BORCS8	Q96FH0	119 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	S1PR3	Q99500	378 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ARV1	Q9H2C2	271 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	NAA60	Q9H7X0	242 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	RFNG	Q9Y644	331 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		A6NJY4	79 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772		K7N7A8	449 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	BMPR1B	O00238	502 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	XRCC2	O43543	280 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	ATG12	O94817	140 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	DIRAS3	O95661	229 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MSI2-216	ENST00000582772	HAND1	O96004	215 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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