RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567954.5

LYRM1-208, Transcript of LYR motif containing 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYRM1, Length 460 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM1-208	ENST00000567954	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	GYPE	P15421	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	HTN1	P15515	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	CEL	P19835	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	LAGE3	Q14657	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	SSX1	Q16384	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	BANF2	Q9H503	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		U3KQE9	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		A0A0J9YX75	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		A8MTW9	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		I3L2K1	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	NME4	O00746	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	SERPINB10	P48595	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	INSL4	Q14641	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		F6UB75	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	HTR1A	P08908	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	UCP1	P25874	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PPP5C	P53041	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TAS2R43	P59537	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	FEV	Q99581	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954		M0R2Z0	102 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PITX3	O75364	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	BPNT1	O95861	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	HRAS	P01112	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	ID1	P41134	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	SCAND1	P57086	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	DOK5	Q9P104	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LYRM1-208	ENST00000567954	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	PRAF2	O60831	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	MT-CO2	P00403	227 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	FGF2	P09038	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	CD3G	P09693	182 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	CRYGA	P11844	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	OSM	P13725	252 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	CD36	P16671	472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	BDKRB2	P30411	391 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	NPBWR1	P48145	328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LYRM1-208	ENST00000567954	PSMB3	P49720	205 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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