RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.04	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0B4J293	547 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf62	A8K5M9	175 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	DISC1	C4P0D8	188 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	TSPAN4	O14817	238 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-CO2	P00403	227 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV1-5	P01602	117 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SNCA	P37840	140 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	IL18	Q14116	193 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MEF2D	Q14814	521 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK9	Q5DT21	86 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RETN	Q9HD89	108 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CTDSPL	O15194	276 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	ST8SIA3	O43173	380 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	GNG7	O60262	68 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	YIF1A	O95070	293 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-48	P01763	117 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479		P0C879	139 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAIN1	P0CW23	69 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	UCP1	P25874	307 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	ETV6	P41212	452 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC35G3	Q8N808	338 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.02	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CDS2	O95674	445 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	NPBWR1	P48145	328 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	DHODH	Q02127	395 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM219A	Q8IW50	185 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	OR10C1	Q96KK4	312 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0G2JRQ6	117 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GVG6	124 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	FABP12	A6NFH5	140 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CORT	O00230	105 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CHEK1	O14757	476 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM50A	O95807	157 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5AC1	P0C628	307 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	TNFSF8	P32971	234 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZRM9	215 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF2	Q99496	336 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	PRRT1	Q99946	306 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		7	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		6.99	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		6.99	□□□□□ -1.29
KIFC3-231	ENST00000567479	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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