RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 CFHR3Q02985 330 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N1Y9 231 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR4A5Q8NH83 315 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR1S1Q8NH92 325 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RHOVQ96L33 236 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RAB40CQ96S21 281 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 BET1LQ9NYM9 111 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CACNG5Q9UF02 275 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.13□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RYR1P21817 5038 aa7.13□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 TAAR5O14804 337 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 MED6O75586 246 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CRYZL1O95825 349 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-16P04430 117 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGF1P05019 195 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CD1BP29016 333 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 G6PCP35575 357 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 REG1BP48304 166 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RAB9AP51151 201 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00205P59089 165 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TNFRSF9Q07011 255 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PMS2P11Q13670 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KLK15Q9H2R5 256 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.12□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 NUPR2A6NF83 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf61A6NNL5 157 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SYNGR2O43760 224 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TSC22D2O75157 780 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 MOSP00540 346 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 S100A10P60903 97 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC51BQ86UW2 128 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM8Q96KF7 97 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM140Q9NV12 185 aa7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA1456Q9P272 454 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 PRNDQ9UKY0 176 aa7.11□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WW49 117 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 WRBO00258 174 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 BCL2L11O43521 198 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SPDEFO95238 335 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA7P01567 189 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV1-51P01701 117 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 SPCS3P61009 180 aa7.1□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 RAB14P61106 215 aa7.1□□□□□ -1.27
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SMAD3-215ENST00000560424 OR5B3Q8NH48 314 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 STOML3Q8TAV4 291 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HARBI1Q96MB7 349 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 ARL6Q9H0F7 186 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 PARP11Q9NR21 331 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TNCP24821 2201 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-215ENST00000560424 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.09□□□□□ -1.27
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