RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CHRNA7	P36544	502 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SMCO1	Q147U7	214 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OXA1L	Q15070	435 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	GPR146	Q96CH1	333 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	NSG2	Q9Y328	171 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		5.86	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	STAB1	Q9NY15	2570 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GW64	132 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312		E7EUB6	86 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ST8SIA3	O43173	380 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	IFNA17	P01571	189 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OPN1MW	P04001	364 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CRYGC	P07315	174 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	HOXB5	P09067	269 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PSMB8	P28062	276 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SPCS3	P61009	180 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PRCD	Q00LT1	54 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TATDN3	Q17R31	274 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CITED1	Q99966	193 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		5.85	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312		H0YIZ8	118 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CYB5B	O43169	146 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SOX15	O60248	233 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PITX3	O75364	302 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ADAP1	O75689	374 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	MYOD1	P15172	320 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	SPN	P16150	400 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CTRB1	P17538	263 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	PSMB6	P28072	239 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TNFRSF9	Q07011	255 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	KLK9	Q2XQG4	91 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	OR1S1	Q8NH92	325 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	HINT2	Q9BX68	163 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	ZFP57	Q9NU63	452 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.84	□□□□□ -1.47
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0G2JLM5	398 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HMX3	A6NHT5	357 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	MED6	O75586	246 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	APELA	P0DMC3	54 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR13C7	P0DN81	318 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	DEFA4	P12838	97 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	AREG	P15514	252 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	RAB9A	P51151	201 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	WT1-AS	Q06250	92 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZWC4	215 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ENY2	Q9NPA8	101 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	THYN1	Q9P016	225 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	ANK2	Q01484	3957 aa		5.83	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		5.82	□□□□□ -1.48
NUMB-231	ENST00000559312	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		5.82	□□□□□ -1.48

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