RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	INIP	Q9NRY2	104 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMA3	Q16787	3333 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPRS	Q13332	1948 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP290	O15078	2479 aa		2.56	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	KNCN	A6PVL3	124 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		A8MT66	165 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1I1	O60431	355 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TRGV3	P03979	118 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OPN1SW	P03999	348 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IL4	P05112	153 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PTHLH	P12272	177 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SPINT3	P49223	89 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYBA4	P53673	196 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		Q5W150	140 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LRP11	Q86VZ4	500 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CD200R1	Q8TD46	325 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	KLK6	Q92876	244 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ALPK3	Q96L96	1907 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		2.55	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO9B	Q13459	2157 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GV72	72 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00862	A6NCI5	91 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	VGLL3	A8MV65	326 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf74	A8MZ97	194 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLL5	B9A064	214 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNA1	P01562	189 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	APOD	P05090	189 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C8G	P07360	202 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MPC1L	P0DKB6	136 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM236C	P0DP71	79 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CD34	P28906	385 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CA5A	P35218	305 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DAP	P51397	102 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RUNX1	Q01196	453 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MOG	Q16653	247 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PYCR3	Q53H96	274 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C2orf83	Q53S99	150 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	RMI2	Q96E14	147 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CNBD2	Q96M20	576 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	IP6K3	Q96PC2	410 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	VCX	Q9H320	206 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	C8orf4	Q9NR00	106 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	PRO0461	Q9UI25	63 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CELA1	Q9UNI1	258 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	F5	P12259	2224 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	OBSL1	O75147	1896 aa		2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH23	Q9H251	3354 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	THADA	Q6YHU6	1953 aa		2.53	□□□□□ -2
FAM49B-222	ENST00000522702	MYLK	Q15746	1914 aa		2.53	□□□□□ -2

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