RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZPA2 131 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 FGFRL1Q8N441 504 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR52E5Q8NH55 327 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 S1PR3Q99500 378 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TAX1BP3O14907 124 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV1-44P01699 117 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LYL1P12980 280 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RUNX1Q01196 453 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LY6DQ14210 128 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CST9LP1Q5W188 147 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE10A6NGK3 116 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00205P59089 165 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ERVK11-1P61568 191 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GNB2P62879 340 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 THYN1Q9P016 225 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LAMA5O15230 3695 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRBP23467 1997 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SRRM5B3KS81 715 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IFNL4K9M1U5 179 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ADH4P08319 380 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SEC11BP0C7V7 166 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF585BQ52M93 769 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CD177Q8N6Q3 437 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 COQ2Q96H96 371 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C18orf12Q96KH6 178 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RAB40CQ96S21 281 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 OR2T8A6NH00 312 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DLL1O00548 723 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB3O43676 98 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV1-46P01743 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GUSBP1Q15486 140 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TESK1Q15569 626 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CALYQ9NYX4 217 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 DPRXA6NFQ7 191 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PSG9Q00887 426 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MSMPQ1L6U9 139 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LCN15Q6UWW0 184 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZWC4 215 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RSG1Q9BU20 258 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 hADV38S2A0JD32 116 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V0CP27449 155 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RND3P61587 244 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 KLRB1Q12918 225 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SPRNQ5BIV9 151 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ERASQ7Z444 233 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RARRES2Q99969 163 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 GCM1Q9NP62 436 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ATMQ13315 3056 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf100A8MU93 164 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf98A8MV24 154 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 ACTL6BO94805 426 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 REG1BP48304 166 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 Q6ZS49 121 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-208ENST00000519076 MUC15Q8N387 334 aa6.49□□□□□ -1.37
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