RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEACAM6P40199 344 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT4P47944 62 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYBA4P53673 196 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC18A1P54219 525 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MFAP4P55083 255 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLDN12P56749 244 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MEF2DQ14814 521 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPV17LQ2QL34 196 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LCE1EQ5T753 118 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOMM20LQ6UXN7 152 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 BAP18Q8IXM2 172 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF679Q8IYX0 411 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 STPG4Q8N801 248 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC37A3Q8NCC5 494 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OR13C3Q8NGS6 347 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SETD6Q8TBK2 473 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SPACA4Q8TDM5 124 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNRF4Q8WWF5 429 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NSL1Q96IY1 281 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST6GAL2Q96JF0 529 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C8orf49Q96NF6 230 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEDD4LQ96PU5 975 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR52B2Q96RD2 323 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EBF4Q9BQW3 602 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf43Q9BWL3 253 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51E2Q9H255 320 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SH3BGRL3Q9H299 93 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51V1Q9H2C8 321 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51M1Q9H341 326 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD19PQ9H560 264 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf21Q9P2W6 132 aa1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 H7BYZ3 331 aa1.12□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 BAG2O95816 211 aa1.12□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GLAP06280 429 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 H1F0P07305 194 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OR13C7P0DN81 318 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-GP17693 338 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPX2P18283 190 aa1.12□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 OMPP47874 163 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPBWR1P48145 328 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMB3P49720 205 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MNAT1P51948 309 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FXYD6P3P58550 94 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 STX1BP61266 288 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSME3P61289 254 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHOBP62745 196 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL8P62917 257 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK5Q00535 292 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF85Q03923 595 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST3GAL4Q11206 333 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARFRP1Q13795 201 aa1.12□□□□□ -2.23
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