RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPCDCQ96CD2 204 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANAPC10Q9UM13 185 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 COQ4Q9Y3A0 265 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM94Q12767 1356 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTC41PQ6P2S7 1318 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 H0YIV9 168 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 AZIN1O14977 448 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRM2P04554 102 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 COX6A1P12074 109 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTNP21246 168 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPERTQ8NA61 448 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR10J5Q8NHC4 309 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MCFD2Q8NI22 146 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLAC4Q8WY50 150 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TIPINQ9BVW5 301 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PSTPIP2Q9H939 334 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HS3ST2Q9Y278 367 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KIF27Q86VH2 1401 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 STX10O60499 249 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR2B3O76000 313 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRT75O95678 551 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL6P05231 212 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNE1P15382 129 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 BLIDQ8IZY5 108 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM213BQ8TBF2 198 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ROPN1LQ96C74 230 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 EFCAB1Q9HAE3 211 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ORMDL1Q9P0S3 153 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ENPP5Q9UJA9 477 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF11Q9Y3C5 154 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RYR2Q92736 4967 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LPAP08519 4548 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TET1Q8NFU7 2136 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 KNTC1P50748 2209 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PQLC2LA1A4F0 135 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF879B4DU55 563 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GOLGA8MH3BSY2 632 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CST4P01036 141 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM228BP0C875 321 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 DDTP30046 118 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCL20P78556 96 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 FABP9Q0Z7S8 132 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAL1Q4LDG9 190 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PROK2Q9HC23 129 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TAS2R7Q9NYW3 318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TOPBP1Q92547 1522 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CACNA1HO95180 2353 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR4C45A6NMZ5 311 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 AHSA1O95433 338 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 IFITM2Q01629 132 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HLA-DRB5Q30154 266 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPATA45Q537H7 98 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM78BQ5VT40 261 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 AADACL3Q5VUY0 350 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 IQCF2Q8IXL9 164 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 TEX47Q8TBZ9 253 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC37A2Q8TED4 501 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 LINC00052Q96N35 136 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBP7Q96R05 134 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 DERL1Q9BUN8 251 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HDHD2Q9H0R4 259 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ASCL3Q9NQ33 180 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 EURLQ9NYK6 297 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 EPDR1Q9UM22 224 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 RABL2BQ9UNT1 228 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 PXMP4Q9Y6I8 212 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 FANCMQ8IYD8 2048 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACANP16112 2415 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANK2Q01484 3957 aa-0.91□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms