RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMBIM6P55061 237 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC35G3Q8N808 338 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF114Q8NC26 417 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TXN2Q99757 166 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM110AQ9BQ89 295 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DISC1C4P0D8 188 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 YIF1AO95070 293 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C15orf62A8K5M9 175 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ST8SIA3O43173 380 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 B3GALNT1O75752 331 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 P0C879 139 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UCP1P25874 307 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ETV6P41212 452 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.42□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TSPAN4O14817 238 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTDSPLO15194 276 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNG7O60262 68 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKAIN1P0CW23 69 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ENY2Q9NPA8 101 aa14.41□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMPXQ9UHP9 88 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RYR3Q15413 4870 aa14.4□□□□□ -0.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR5AC1P0C628 307 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NPBWR1P48145 328 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NAA60Q9H7X0 242 aa14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0G2JRQ6 117 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR4C46A6NHA9 309 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDS2O95674 445 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHODHQ02127 395 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRRT1Q99946 306 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR132Q9UNW8 380 aa14.38□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H3BMQ9 156 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHEK1O14757 476 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q6ZRM9 215 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM219AQ8IW50 185 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OR10C1Q96KK4 312 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF2Q99496 336 aa14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FABP12A6NFH5 140 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CORTO00230 105 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNFSF8P32971 234 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPCS3P61009 180 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MCFD2Q8NI22 146 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IL17DQ8TAD2 202 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM50AO95807 157 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GINS3Q9BRX5 216 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MCUBQ9NWR8 336 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.35□□□□□ -0.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms