RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SLC25A15Q9Y619 301 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 USF3Q68DE3 2245 aa13.64□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 IGLC7A0M8Q6 106 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 LINC00473A8K010 186 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR9G9P0C7N8 305 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 MPV17P39210 176 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 TIMM23BQ5SRD1 257 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 STPG3Q8N7X2 389 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 RCHY1Q96PM5 261 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 C3orf80F5H4A9 247 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 RBPJQ06330 500 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR4C5Q8NGB2 326 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 C1RLQ9NZP8 487 aa13.63□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SPINT2O43291 252 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR20EP86478 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR20CP86479 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR20DP86480 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR20BP86481 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PRR20AP86496 221 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 CHRDL1Q9BU40 450 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PRE2 83 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 H0YJW9 148 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PSPNO60542 156 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 TAS2R45P59539 299 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 RHOGP84095 191 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SPINK9Q5DT21 86 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 LYG1Q8N1E2 194 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.62□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 A0A0G2JNJ9 132 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PPOXP50336 477 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR8B3Q8NGG8 313 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR8B2Q96RD0 313 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 CLEC7AQ9BXN2 247 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 Q9UFV3 132 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SPTA1P02549 2419 aa13.61□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 LOC105371242A0A075B767 164 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 HSBP1O75506 76 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 GABRA2P47869 451 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 REG1BP48304 166 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 ST20Q9HBF5 79 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 J3QR06 171 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 GPR12P47775 334 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 RELBQ01201 579 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR2V2Q96R30 315 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 WNT10AQ9GZT5 417 aa13.6□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 BSNQ9UPA5 3926 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 OR2J3O76001 311 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 NPY1RP25929 384 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 C3orf36Q3SXR2 165 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PET117Q6UWS5 81 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 COQ2Q96H96 371 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 C1orf159Q96HA4 380 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PSG11Q9UQ72 335 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 TCF19Q9Y242 345 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 GRPP07492 148 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 CRYBB3P26998 211 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 UBE2G1P62253 170 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 KLRB1Q12918 225 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 NEUROG1Q92886 237 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 JPT1Q9UK76 154 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 PPIAL4AQ9Y536 164 aa13.59□□□□□ -0.23
SYP-208ENST00000494396 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 M0R1B8 84 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FCGR3BO75015 233 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 AESQ08117 197 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 FAM27E3Q08E93 113 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 PSG5Q15238 335 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 KIAA1644Q3SXP7 199 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.58□□□□□ -0.24
SYP-208ENST00000494396 NTF3P20783 257 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.8 ms