RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487701.1

SEC22C-215, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, human

TSL 3

Gene SEC22C, Length 729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC22C-215	ENST00000487701	UCP1	P25874	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PSMB6	P28072	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	CD40LG	P29965	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	BAK1	Q16611	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PRRT1	Q99946	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701		A0A0B4J293	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701		A0A0G2JLM5	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	BMPR1B	O00238	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SNAPC5	O75971	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR2J3	O76001	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	NDUFB8	O95169	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	CDS2	O95674	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SERPINE2	P07093	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	MFAP2	P55001	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701		S4R3C0	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OVOL1	O14753	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	BTC	P35070	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	AKR1C2	P52895	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	AP3S2	P59780	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TMEM187	Q14656	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SEC22C-215	ENST00000487701	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701		K7EIL1	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	DHFR	P00374	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	DEFA4	P12838	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	IL7	P13232	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SEC22C-215	ENST00000487701	AKR1C4	P17516	323 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms