RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 OR13C4Q8NGS5 318 aa0.58□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 ULBP3Q9BZM4 244 aa0.58□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 DRC3Q9H069 523 aa0.58□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 PIK3R4Q99570 1358 aa0.57□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 PHGR1C9JFL3 82 aa0.57□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 INE1O15225 51 aa0.57□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 EVPLLA8MZ36 301 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 LRRN3E7EW58 273 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 M0QX08 132 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 KCNK1O00180 336 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 KHDC3LQ587J8 217 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 MIR17HGQ75NE6 70 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 RASL12Q9NYN1 266 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 USE1Q9NZ43 259 aa0.56□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 A0A1W2PPM0 123 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 OR2B3O76000 313 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 IGKV1-5P01602 117 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 CRYGAP11844 174 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 RPS12P25398 132 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 RAB8BQ92930 207 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 CFAP53Q96M91 514 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 ACER3Q9NUN7 267 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 TAS2R4Q9NYW5 299 aa0.55□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 H0Y980 276 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 UBL3O95164 117 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 TCL1BO95988 128 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 RHEBQ15382 184 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 FAM151BQ6UXP7 276 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 TMEM156Q8N614 296 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 TMEM147Q9BVK8 224 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 C9orf84Q5VXU9 1444 aa0.54□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 DEXIO95424 95 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 PDPK2PQ6A1A2 396 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 OR51D1Q8NGF3 324 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 OR5A1Q8NGJ0 315 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 SFT2D1Q8WV19 159 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 OPTNQ96CV9 577 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 EVC2Q86UK5 1308 aa0.53□□□□□ -2.32
USP34-216ENST00000487547 PEAK1Q9H792 1746 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 IFNA10P01566 189 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 OR5G3P0C626 314 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SSR2P43308 183 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TCL1AP56279 114 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 HBA1P69905 142 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 C4orf3Q8WVX3 66 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 DNAJC9Q8WXX5 260 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 KLK6Q92876 244 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 COMMD5Q9GZQ3 224 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 OR51I1Q9H343 314 aa0.52□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 PROSCO94903 275 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 MAGEA2P43356 314 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 PMAIP1Q13794 54 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 LPCAT3Q6P1A2 487 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SFXN4Q6P4A7 337 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TERB2Q8NHR7 220 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 BORCS5Q969J3 196 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TMEM70Q9BUB7 260 aa0.51□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TPM3P06753 285 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 MPV17LQ2QL34 196 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 LPCAT4Q643R3 524 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa0.5□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 MTUS2Q5JR59 1369 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 PQLC2LA1A4F0 135 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 NCR3O14931 201 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TNNC2P02585 160 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 TPM4P67936 248 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SLC39A9Q9NUM3 307 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 CMTM6Q9NX76 183 aa0.49□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 SULT1B1O43704 296 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 DCTN3O75935 186 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 ISG15P05161 165 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 HIST3H2BBQ8N257 126 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 ITFG2Q969R8 447 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 FBXL12Q9NXK8 326 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 HS3ST2Q9Y278 367 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 USP24Q9UPU5 2620 aa0.48□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 LYZL6O75951 148 aa0.47□□□□□ -2.33
USP34-216ENST00000487547 CNBPP62633 177 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms