RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 DERL2Q9GZP9 239 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SAR1AQ9NR31 198 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ATPIF1Q9UII2 106 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ERGIC3Q9Y282 383 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RTL9Q8NET4 1388 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PLIN4Q96Q06 1357 aa1.07□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PLXNA2O75051 1894 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 UBR3Q6ZT12 1888 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CCDC160A6NGH7 325 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 COPEO14579 308 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 EDF1O60869 148 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 HLA-DRAP01903 254 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 REG1AP05451 166 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 FAM228BP0C875 321 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 HOXA6P31267 233 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 IFNGR2P38484 337 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 XCL1P47992 114 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 TAS2R45P59539 299 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 MGAT3Q09327 533 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 MED21Q13503 144 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 MOGQ16653 247 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CLEC12BQ2HXU8 276 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RGS21Q2M5E4 152 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CLVS2Q5SYC1 327 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SDHAF4Q5VUM1 108 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 DNM1P34Q6PK57 102 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CROCCP2Q86T23 111 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 OR4X1Q8NH49 305 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 DDI1Q8WTU0 396 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CYGBQ8WWM9 190 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ASB13Q8WXK3 278 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SLC35G5Q96KT7 338 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 MND1Q9BWT6 205 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SPZ1Q9BXG8 430 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SLC22A4Q9H015 551 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 UCK1Q9HA47 277 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RNF11Q9Y3C5 154 aa1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 HEATR5AQ86XA9 2040 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 COL4A1P02462 1669 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ZNF831Q5JPB2 1677 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PQD3 144 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RFPL4AA6NLU0 287 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 EVPLLA8MZ36 301 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 H0YJX3 145 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 J3QRK9 145 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 UBE2L6O14933 153 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 SULT1B1O43704 296 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 KLRC4O43908 158 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 KRT75O95678 551 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 HMGN1P05114 100 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 IL6P05231 212 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 DEFA4P12838 97 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ATP6V0CP27449 155 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CASP1P29466 404 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CD40LGP29965 261 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R2P41236 205 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CTBP2P56545 445 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 MAP3K7CLP57077 242 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 TMEM33P57088 247 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CDK10Q15131 360 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ALX1Q15699 326 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 Q5BKY6 102 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 BRMS1LQ5PSV4 323 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 LPCAT4Q643R3 524 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PDPK2PQ6A1A2 396 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 Q6ZS52 159 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 LINC00299Q6ZSB3 139 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 AKAP14Q86UN6 197 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 ZNF283Q8N7M2 679 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 CLDND2Q8NHS1 167 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 GRPEL2Q8TAA5 225 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 RASSF5Q8WWW0 418 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 PYDC1Q8WXC3 89 aa1.05□□□□□ -2.24
SENP6-208ENST00000483859 NMNAT3Q96T66 252 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms