RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA14P01570 189 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 APOC1P02654 83 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LIMS3P0CW19 117 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LIMS4P0CW20 117 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 EVI2BP34910 448 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 APLNRP35414 380 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 HAAOP46952 286 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IDH2P48735 452 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CDK5Q00535 292 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 BTN1A1Q13410 526 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB134Q4QY38 66 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PCP2Q8IVA1 136 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LYG1Q8N1E2 194 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DRAM1Q8N682 238 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MORN4Q8NDC4 146 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1J4Q8NGS1 313 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF721Q8TF20 911 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 HGDQ93099 445 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR52D1Q9H346 318 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TAC3Q9UHF0 121 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MMACHCQ9Y4U1 282 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.69□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 M0R1X1 148 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MANBAO00462 879 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CCL22O00626 93 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CHP2O43745 196 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ANGPTL7O43827 346 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5F1O95221 314 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PET100P0DJ07 73 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF35P13682 527 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ELK1P19419 428 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DTYMKP23919 212 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CCR7P32248 378 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TTPAP49638 278 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 GZMMP51124 257 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 CTBP2P56545 445 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RAP1AP62834 184 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXC5Q00444 222 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 SSX1Q16384 188 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IDNKQ5T6J7 187 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5AK3PQ8NH89 298 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1S1Q8NH92 325 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF138Q8WVD3 245 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAP1Q96NZ9 151 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL26Q96S19 204 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RSG1Q9BU20 258 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PKD1P98161 4303 aa3.68□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A0U1RQV1 116 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 C7orf66A4D0T2 115 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TAAR5O14804 337 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 DHRS3O75911 302 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LYZL6O75951 148 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB36O95755 333 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 LHBP01229 141 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IGLV2-8P01709 118 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA4P05014 189 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 GPX2P18283 190 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 PRPS1L1P21108 318 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 AGTR1P30556 359 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 TGM4P49221 684 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 EVX1P49640 407 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF83P51522 516 aa3.67□□□□□ -1.82
STRADBP1-201ENST00000478954 AKR1D1P51857 326 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms