RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472880.1

COL9A3-210, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 959 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF114Q8NC26 417 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM116Q8NCL8 245 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 RNF183Q96D59 192 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 RNF2Q99496 336 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 TXN2Q99757 166 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 H3BMQ9 156 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 I3L2K1 104 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 CTDSP2O14595 271 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGKV1-39P01597 117 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGKV1D-39P04432 117 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 UCP3P55916 312 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 ABHD1Q96SE0 405 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 KLK11Q9UBX7 282 aa14.62□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 CHEK1O14757 476 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 GNG7O60262 68 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 LY6G6CO95867 125 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 MT-CO2P00403 227 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 TFPI2P48307 235 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 APRG1Q8IVJ8 170 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 OR52I2Q8NH67 350 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 OR10C1Q96KK4 312 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 GINS3Q9BRX5 216 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 M0QYG6 137 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGHV3-48P01763 117 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 PGAM2P15259 253 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-210ENST00000472880 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 AKR1C2P52895 323 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 SPINK9Q5DT21 86 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 SLC35G3Q8N808 338 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 GABARAPH6UMI1 98 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CD3DP04234 171 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 NPBWR1P48145 328 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 RND3P61587 244 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 PAFAH1B2P68402 229 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF124Q15973 351 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 GBGT1Q8N5D6 347 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CSTL1Q9H114 145 aa14.57□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 MPTX1A8MV57 137 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CD5P06127 495 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 PI3P19957 117 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TBPP20226 339 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 SNCAP37840 140 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 PIGPP57054 158 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TCF24Q7RTU0 167 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.56□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ATG12O94817 140 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 IFNA17P01571 189 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 IL18Q14116 193 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.55□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CCDC160A6NGH7 325 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CORTO00230 105 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CTDSPLO15194 276 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ST8SIA3O43173 380 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 IGKV1-5P01602 117 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 CD74P04233 296 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 PPP5CP53041 499 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TAS2R19P59542 299 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 MCFD2Q8NI22 146 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 ST8SIA2Q92186 375 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 TP53RKQ96S44 253 aa14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
COL9A3-210ENST00000472880 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms