RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	BTNL8	Q6UX41	500 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880		V9GYH0	126 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SSR4-208	ENST00000471880	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	GNG7	O60262	68 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA3	P12429	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N1Y9	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	NEURL2	Q9BR09	285 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	MLX	Q9UH92	298 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		A8MWP6	167 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CDS2	O95674	445 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF79	Q15937	498 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM63	Q969Q1	353 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CD7	P09564	240 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		P0C879	139 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	VAMP1	P23763	118 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZRM9	215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF114	Q8NC26	417 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	MARC2	Q969Z3	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		I3L2K1	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA4	O00483	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	OPRK1	P41145	380 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SPCS3	P61009	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM187	Q14656	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB125	Q8N687	156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF785	A8K8V0	405 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CORT	O00230	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	CTSG	P08311	255 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ADM	P35318	185 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	NPBWR1	P48145	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	LGI3	Q8N145	548 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	OR11H12	B2RN74	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SRPX	P78539	464 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	IL22RA2	Q969J5	263 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT14	Q96FL9	552 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TXN2	Q99757	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	HTR2B	P41595	481 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	CCR6	P51684	374 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.4 ms