RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	AREG	P15514	252 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	BLCAP	P62952	87 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS13	O14921	159 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	CYB5B	O43169	146 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	IFITM2	Q01629	132 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	CD69	Q07108	199 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	GINS3	Q9BRX5	216 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC01548	A6NM66	108 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BUA1	57 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	AP4M1	O00189	453 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX15	O60248	233 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	MPDU1	O75352	247 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA5	P01569	189 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SRD5A1	P18405	259 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	MFAP2	P55001	183 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V0B	Q99437	205 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	HILS1	P60008	231 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	THYN1	Q9P016	225 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM77	I1YAP6	450 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529		I3L2K1	104 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA7	P01567	189 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM157C	P0CG43	387 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SPP1	P10451	314 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	CFHR3	Q02985	330 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	GAMT	Q14353	236 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	CLINT1	Q14677	625 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	LILRB2	Q8N423	598 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	MDFI	Q99750	246 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	PARP11	Q9NR21	331 aa		10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV1-40	P01703	118 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	REG1A	P05451	166 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFA4	P12838	97 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	SERF2	P84101	59 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529		Q6ZS46	218 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4X1	Q8NH49	305 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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