RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468638.1

INPP4A-208, Transcript of inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A, human

TSL 3

Gene INPP4A, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INPP4A-208	ENST00000468638	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	GPR183	P32249	361 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ARL3	P36405	182 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.49	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	CLEC3B	P05452	202 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	TNFRSF9	Q07011	255 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.48	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638		I3L2K1	104 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	WIPF1	O43516	503 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	PITX3	O75364	302 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	SAP30	O75446	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ADAP1	O75689	374 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	OR2C1	O95371	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	MT-CO2	P00403	227 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	SLC25A6	P12236	298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		13.47	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	INSL3	P51460	131 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638		Q56UQ5	140 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638	RBKS	Q9H477	322 aa		13.46	□□□□□ -0.25
INPP4A-208	ENST00000468638		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	TGOLN2	O43493	480 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	HTR2B	P41595	481 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	MPTX1	A8MV57	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	CORT	O00230	105 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IFNA21	P01568	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	DEFA1	P59665	94 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	DEFA3	P59666	94 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ATP6V0B	Q99437	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	PEMT	Q9UBM1	199 aa		13.44	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	NPY1R	P25929	384 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	OPRK1	P41145	380 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	MFAP4	P55083	255 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	LGALS9	O00182	355 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	CSN3	P07498	182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IAPP	P10997	89 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	REC114	Q7Z4M0	266 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	MED6	O75586	246 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	IFNA10	P01566	189 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ADM	P35318	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	TXN2	Q99757	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638		U3KQ87	197 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	SORL1	Q92673	2214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
INPP4A-208	ENST00000468638	CCS	O14618	274 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms