RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 MOB3BQ86TA1 216 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ACY3Q96HD9 319 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR6C3Q9NZP0 311 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 HPRT1P00492 218 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PF4V1P10720 104 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 LYL1P12980 280 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 BPIFB3P59826 476 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TNFRSF9Q07011 255 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 C1QL4Q86Z23 238 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ABHD14BQ96IU4 210 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GUS0 222 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 M0QZ24 198 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 M0QZK8 103 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 SLC17A3O00476 420 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PF4P02776 101 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 AESQ08117 197 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 FXYD3Q14802 87 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 Q56UQ5 140 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF714Q96N38 554 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR5G3P0C626 314 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 GZMBP10144 247 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TCTAP57738 103 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 COTL1Q14019 142 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 RPEL1Q2QD12 228 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PNKDQ8N490 385 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 P2RX4Q99571 388 aa4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 HAND1O96004 215 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR10J4P0C629 311 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PRTN3P24158 256 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 UCP3P55916 312 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PSG5Q15238 335 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR5R1Q8NH85 324 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 S1PR3Q99500 378 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TIMM23O14925 209 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 CA11O75493 328 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 UCP1P25874 307 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 HTR1DP28221 377 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ATP5G3P48201 142 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 SPATA45Q537H7 98 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 MIC13Q5XKP0 118 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 COL6A5A8TX70 2615 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 MGST3O14880 152 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 WNT9BO14905 357 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 WNT2P09544 360 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ANOS1P23352 680 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 OR1L1Q8NH94 360 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 R3HDM4Q96D70 268 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 BET1LQ9NYM9 111 aa4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM50AO95807 157 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 CSN3P07498 182 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ADH4P08319 380 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 CD1BP29016 333 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 RAB7AP51149 207 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 UBE2G1P62253 170 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ID3Q02535 119 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 ATP6V1FQ16864 119 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 C1RLQ9NZP8 487 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 M0R2Z0 102 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-205ENST00000468371 PDE6DO43924 150 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms