RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNAPC5O75971 98 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT-CO2P00403 227 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-5P01602 117 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOA1P02647 267 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q56UQ5 140 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPINK9Q5DT21 86 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALNT14Q96FL9 552 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM56Q96MV1 263 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.2□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXorf65A6NEN9 183 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUPR2A6NF83 97 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0QYG6 137 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYB5BO43169 146 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LY6G6CO95867 125 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCVRNP35243 200 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MFAP4P55083 255 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RND3P61587 244 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 VBP1P61758 197 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST8SIA2Q92186 375 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MISP3Q96FF7 219 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTM3Q96MX0 182 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TP53RKQ96S44 253 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSC22D3Q99576 134 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TXN2Q99757 166 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSIRQ9H7M9 311 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLK11Q9UBX7 282 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.19□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAH2Q9P225 4427 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087WXM4 84 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0B4J293 547 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GU03 582 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PI3P19957 117 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFPI2P48307 235 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCF24Q7RTU0 167 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 STPG3Q8N7X2 389 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR52I2Q8NH67 350 aa6.18□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 A6NJY4 79 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST8SIA3O43173 380 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEDDO75618 318 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFAIP8O95379 198 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM50AO95807 157 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM18P0DKX4 95 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN5P62079 268 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTF1Q16619 201 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLANAQ16655 118 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 BSXQ3C1V8 233 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZRM9 215 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR4A16Q8NH70 328 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABHD1Q96SE0 405 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CSTL1Q9H114 145 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.17□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNG7O60262 68 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 DFFBO76075 338 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 YIF1AO95070 293 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABARAPO95166 117 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD74P04233 296 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD3DP04234 171 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 UCP1P25874 307 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIGPP57054 158 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 AARDQ4LEZ3 155 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.16□□□□□ -1.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.16□□□□□ -1.42
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