RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIQKQ629K1 86 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LGI3Q8N145 548 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC35G3Q8N808 338 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S100ZQ8WXG8 99 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4C12Q96R67 309 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HINT2Q9BX68 163 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1B0GU03 582 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP5D1E7EU14 171 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2C1O95371 312 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SFT2D2O95562 160 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTSGP08311 255 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C8orf88P0DMB2 117 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADMP35318 185 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CACNG5Q9UF02 275 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPXA8MT69 81 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TGOLN2O43493 480 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAP30O75446 220 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNA17P01571 189 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARL3P36405 182 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HTR2BP41595 481 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP1R1AQ13522 171 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PEMTQ9UBM1 199 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C9orf170A2RU37 121 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 K7EMT4 169 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CORTO00230 105 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYRM1O43325 122 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNCAP37840 140 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 INPP1P49441 399 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF9Q07011 255 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMCO1Q147U7 214 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf83Q53S99 150 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM213A2RRL7 107 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf70A6NJV1 201 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A8MZ25 164 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MT-CO2P00403 227 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV3-23P01764 117 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOLR2P14207 255 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPNP16150 400 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR183P32249 361 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFAP4P55083 255 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLET1Q6UQ28 207 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N1Y9 231 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRAPQ8TCY5 172 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MARC2Q969Z3 335 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR10C1Q96KK4 312 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR13Q9NZ81 148 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 S4R3C0 116 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 U3KQ87 197 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFA4O00483 81 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCRBP04435 133 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4E1P0C645 316 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GP9P14770 177 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CBLN1P23435 193 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHRS2Q13268 280 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASAH1Q13510 395 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPINK9Q5DT21 86 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYG2Q86SG7 212 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MITD1Q8WV92 249 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms