RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 OR10C1Q96KK4 312 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 CMTM3Q96MX0 182 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TSC22D3Q99576 134 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.57□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 I3L2K1 104 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 GNG7O60262 68 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 MT-CO2P00403 227 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 HRH1P35367 487 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 VBP1P61758 197 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 NCS1P62166 190 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 SPINK9Q5DT21 86 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 LEMD1Q68G75 181 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TCF24Q7RTU0 167 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 ST8SIA2Q92186 375 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 MFFQ9GZY8 342 aa8.56□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 H3BMQ9 156 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 ST8SIA3O43173 380 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IFNA4P05014 189 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 HLA-DMAP28067 261 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TMBIM6P55061 237 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 OR4A16Q8NH70 328 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 GINS3Q9BRX5 216 aa8.55□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 GABARAPO95166 117 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV1-39P01597 117 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IGKV1D-39P04432 117 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 S100GP29377 79 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 DEFB131AP59861 70 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TSPAN5P62079 268 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PAFAH1B2P68402 229 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRR20EP86478 221 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRR20CP86479 221 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRR20DP86480 221 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRR20BP86481 221 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRR20AP86496 221 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRCDQ00LT1 54 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM187Q14656 261 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 SPCS2Q15005 226 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 CTF1Q16619 201 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 CADM3Q8N126 398 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF114Q8NC26 417 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 SEC22AQ96IW7 307 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 TXN2Q99757 166 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PKHD1P08F94 4074 aa8.54□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 DFFBO76075 338 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 NAT1P18440 290 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PRSS3P35030 304 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 LILRB2Q8N423 598 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 RABAC1Q9UI14 185 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 DNAH2Q9P225 4427 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.53□□□□□ -1.04
GARNL3-210ENST00000453030 IGLL5B9A064 214 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM127O75204 238 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 STHQ8IWL8 128 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 VSIRQ9H7M9 311 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.52□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 NPBWR1P48145 328 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 AKR1C2P52895 323 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 SLC35G3Q8N808 338 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 Q8NAQ8 132 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.51□□□□□ -1.05
GARNL3-210ENST00000453030 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.51□□□□□ -1.05
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